菏澤市中醫醫院始建于1975年，1979年正式開診，建院有近50年的歷史，占地面積3.5萬平方米，建筑面積10.1萬平方米，開放床位1100張。1996年12月被國家中醫藥管理局評為三級甲等中醫院，2013年12月、2018年12月、2023年5月通過周期性三甲復審，是菏澤市一家集醫療、教學、科研、預防、康復、養老、急救功能于一體的三級甲等中醫醫院，是國家中醫住院醫師規范化培訓基地、國家醫師資格實踐技能考試菏澤基地、山東中醫藥大學實踐技能考試基地。?菏澤市中醫醫院科室設置齊全，設有臨床科室42個，醫技科室17個，國家級重點專科3個，省級重點專科10個，市級重點專科、學科24個，齊魯中醫藥優勢專科集群牽頭專科1個、成員專科11個，國家藥物/器械臨床試驗機構1個，醫學生殖中心1個。建立王新陸國醫大師血濁研究工作室、國醫大師李佃貴傳承工作室、山東省名中醫閻兆君教授工作室、肝膽外科盧俊教授工作室、張師前教授名醫工作室、江學良教授博導工作室等。兒科是國家級重點專科，2022年3月獲批齊魯中醫藥優勢專科兒科集群牽頭單位，2023年被評為國家中醫優勢專科建設項目，有山東省名老中醫1名，碩士研究生導師兩名。生殖中心通過山東省衛健委“試管嬰兒”技術正式運行評審，成為菏澤首家準予正式開展此項技術的醫療機構。菏澤中醫醫院皮膚美容科成立于1985年，是集醫療、教學、科研于一體的皮膚病性病專科，屬省級中醫重點專科。擁有醫護人員31人，其中主任醫師1名，副主任醫師4名，主治醫師1名，住院醫師5名，護理19人，其中碩士研究生7名；擁有丹陽路總院皮膚科及中華東路分院皮膚科兩個院區合計4間門診和14間治療室、65張住院床位，是菏澤地區有獨立皮膚科病房的較大規模皮膚科團隊。科室先后派醫師到山東省中醫院，復旦大學附屬華山醫院，山東省皮膚病醫院，上海交通大學附屬瑞金醫院，廣州省中醫院進修學習；開展了毛發、皮膚外科等亞專業；目前擁有皮膚鏡影像處理系統、冰點脫毛治療儀，激光生發治療儀，毛囊提取儀影像處理系統、無針水光儀、308準分子光、紫外線光療儀（全倉、半倉、局部）、調Q激光、紅藍光治療儀、高頻電離子等先進的現代化治療設備，開展激光美容、真菌熒光鏡檢、皮膚腫物切除術、皮膚病理活檢、果酸活膚術、過敏原檢查（點刺試驗+斑貼試驗）、高頻電離子、液氮冷凍治療等項目，并開展了中藥熏洗、中藥封包、火針治療、埋線治療、穴位注射、熱敏灸、貼棉灸、截根療法等十多項中醫特色治療項目，凸顯了中醫特色治療優勢。?